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带负电的DNA,为什么还能靠近?科学家首次直接看见它的配对

约2分钟读完 Tiny Why编辑部 · 文:特派员 好奇

词语
DNA

细胞里保存生物重要信息的物质。

原子力显微镜

用来观察极小表面形状的仪器。

二价金属离子

带两个正电荷、能帮助DNA靠近的金属粒子。

发生了什么

DNA(脱氧核糖核酸)带有负电荷。两个带负电的东西通常会互相排斥。可是,在细胞里,DNA有时必须靠近另一段DNA,并识别相似的序列。这类接触与遗传重组、基因沉默、染色体包装等过程有关,也可能与癌症中的细胞异常有关。

来自英国谢菲尔德大学和约克大学的研究者,首次直接拍到了两条DNA双螺旋紧密配对的结构。研究团队用高分辨率原子力显微镜扫描短DNA片段。图像显示,两条螺旋的沟槽能够彼此对齐。研究结果发表在《核酸研究》上,并为提出二十多年的DNA拉链模型提供了直接的结构证据。研究论文

这个谜题为什么难

DNA带负电,按道理不容易靠近。二十多年前提出的DNA拉链模型认为,DNA周围的盐离子会进入螺旋沟槽,形成有规律的电荷分布。这样的分布可以帮助相邻DNA保持合适的方向。过去,研究者虽然有这个想法,却很难直接看到沟槽对齐的样子。

研究者看到了什么

这项研究把显微镜观察和计算机模拟结合起来。显微镜告诉研究者DNA最后呈现什么形状。模拟则追踪原子和离子怎样移动。结果显示,二价金属离子(带两个正电荷的金属离子)可以同时接触两条DNA,在它们之间形成稳定的离子连接。镍、镁、钙离子都能帮助配对,但它们喜欢的位置和连接方式并不完全相同。

DNA也不是在每个位置都同样容易配对。有些序列会形成更强的接触点,也就是配对热点。论文还观察到,相似序列和不相似序列都能发生接触。这说明,序列相似性可能不一定负责启动第一次接触,却可能帮助接触保持更久,并沿着较长的DNA继续延伸。

为什么重要

这项成果把一个长期停留在理论中的过程,变成了可以观察和计算解释的结构。它可能帮助研究者理解DNA怎样压缩成染色体,以及DNA分子怎样参与遗传重组和基因调节。研究者还提出,能按序列控制接触强弱,未来或许有助于设计定制DNA结构。不过,这些仍是研究方向,不是已经完成的医疗或工程应用。

还不能确定什么

实验使用的是较短的DNA片段,以及离子种类和浓度都经过控制的溶液。显微镜还需要把DNA放在表面上观察。计算机模拟也无法完全复制活细胞拥挤而复杂的环境。因此,目前还不知道活细胞里同样配对会多常出现,也不知道这些热点是否真的会影响癌症发生。

接下来关注什么

下一步可以观察更长的DNA,或在更接近细胞的环境中测试。研究者还需要比较不同离子和不同序列,找出接触如何开始、又怎样持续。DNA拉链模型第一次有了清晰的结构图,这为理解染色体的组织方式提供了新的研究起点。约克大学研究报道

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金属小粒帮助DNA靠近

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DNA通常会互相推开。研究者发现,带正电的金属离子能帮助两条DNA对齐。

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词语
DNA

细胞里保存重要信息的物质。

原子力显微镜

用来观察极小表面形状的仪器。

正电金属离子

带正电、能帮助DNA靠近的金属小粒。

💡 一句话总结

  • DNA带负电,通常会互相推开。
  • 正电金属离子帮助两条DNA靠近并对齐。
  • 新研究支持了提出二十多年的DNA拉链模型。

DNA(细胞里保存重要信息的物质)带负电。两条DNA本来容易互相排斥,可细胞有时又需要它们靠近。遗传重组、让某些基因安静下来,以及把DNA收进染色体,都需要DNA之间有合适的接触。

英国谢菲尔德大学和约克大学的研究者,用原子力显微镜观察短DNA片段。这个仪器能描出非常小的表面形状。图像显示,两条DNA双螺旋的沟槽可以对齐。

研究者还用计算机模拟原子和离子的运动。结果显示,镍、镁、钙等正电金属离子,可以同时碰到两条DNA。它们帮助DNA保持靠近。不同DNA序列的效果不一样。有些位置更容易形成较强接触。相似序列可能帮助接触维持更久,但不相似序列也可能先碰到一起。

这项研究支持DNA拉链模型。这个模型认为,DNA周围的离子能帮助两条DNA排好位置。它可能帮助解释DNA怎样收成染色体,也可能帮助未来设计新的DNA结构。

不过,研究在短片段和控制好的溶液中进行。活细胞更加复杂。现在还不能说细胞里一定会用同样的方式,也不能说它已经带来癌症治疗。研究论文

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DNA也能靠近了

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DNA(身体里传递小指令的东西)也能靠近了。

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词语
DNA

身体里传递小指令的东西。

金属小粒

能帮助DNA靠近的小小金属粒子。

它带着负电。 两个负电常常会互相推开。

约克大学(英国的大学)的研究者看见了它。 谢菲尔德大学(英国的大学)也参加了研究。 他们用特别的显微镜。 它能看见很小的形状。

正电的金属小粒靠近了DNA。 它们帮助两根DNA排好沟槽。 这像拉上一条小拉链。

有些地方更容易靠近。 可是,活细胞里会不会一样? 科学家还不知道。 他们会继续寻找答案。简单研究报道

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